Né fils unique d’un couple de la classe moyenne qui n’a très vite pas su quoi faire de son enfant. Le plus beau cadeau qu’ils lui ont fait – mis à part le livrer à Umbrella Corporation – était un kit du petit chimiste pour son 6ème anniversaire. Il ne l’a pas laché, a fait toutes les expériences possibles et imaginables. Enfant curieux mais étrange, il a vite compris que l’humanité était en proie à une impasse évolutive et a toujours nourri un dédain certain envers l’humanité.

C’est à l’âge de 8ans qu’Umbrella corporation l’intégra au projet Progenitor avec douze autres enfants. On lui fit passer de nombreux tests, on lui injecta des doses du virus Progenitor sous la supervision du Docteur Wesker et d’Oswell E. Spencer. Seul lui et une jeune fille survécurent.

A 17ans, Albert rejoint officiellement l’entreprise pharmaceutique Umbrella et commence à travailler en tant que chercheur au coté de William Birkin et sous la houlette du Docteur James Marcus. Il se lit d’une amitié – et attirance – profonde pour William Birkin.

Albert travaille dur, aidé par une intelligence hors du commun et il se retrouve bientôt à faire des recherches sur le virus Ebola afin d’en comprendre le fonctionnement et découvrir les secrets de la modification génétique d’un virus. Pendant 13ans, Birkin et lui travaillèrent sur le Virus T et créèrent une arme biologique appelé Tyran. C’est à cette époque que Spencer leur ordonna de tuer leur mentor James Marcus et de voler ses recherches. Wesker s’exécuta mais devint méfiant des intentions de Spencer et décida de mener l’enquête sur ses véritables intentions.

Wesker rejoignit par la suite l’équipe des S.T.A.R.S une division spécial de Raccoon City de laquelle il devient rapidement capitaine. Jouant l’agent double au profit d’Umbrella, il fait la connaissance de Jill Valentine, Chris Redfield, Rebecca Chambers, Barry Burton et Brad Vickers qui seront sous ses ordres jusqu’à ce qu’il les trahisse.

Trahir, il le fait également avec Umbrella, sentant le vent tourné et cherchant à poursuivre ses propres intérêts. Suite aux événements du Manoir Spencer, Wesker s’injecte un virus expérimental et se fait passer pour mort alors que ses anciens subordonnés découvrent qu’il avait prévu de voler les recherches d’Umbrella pour son compte.

Changé profondément par l’injection du virus, Wesker développe des capacités extraordinaires, il est plus rapide, plus fort. Il rejoint l’entreprise concurrente d’Umbrella l’Organisation et y continue ses recherches sur les virus. Tout en gardant un œil sur les opérations des anciens S.T.A.R.S et d’Umbrella. Il envoie notamment Ada Wong récupérer le Virus G créé par Birkin et apprend ainsi l’existence de Léon Kennedy. Lentement mais sûrement ses émotions se transforment en haine, il deteste tous les anciens membres de son équipe qui lui mettent des bâtons dans les roues, il déteste Spencer, il déteste Umbrella. Il déteste l’humanité tout entière.

Au cours de ses divers plans – trop souvent déjoués par Chris, Sheva ou Ada – il met au point le virus Uroboros qu’il voit comme la prochaine étape de l’évolution humaine. En effet, si le virus tue une grande partie des cobayes auquel il est injecté, il créé chez les autres des humains supérieurs comme lui l’est devenu. Il décide alors de relâcher Uroboros sur l’humanité et ainsi créé une sélection naturelle. Seuls les plus forts survivront et deviendront supérieurs. Sur de ses projets, il s’injecte lui-même sa création renforçant un peu plus ses capacités.

C’est lors d’une confrontation avec Chris et Sheva, qu’il sent un étrange brouillard noir l’entourer et il disparaît.

Wesker réapparaît alors dans un univers bien loin du sien dans lequel une entité le pousse à sacrifier lors de « trials » d’autres êtres vivants. Albert exulte de ces entraînements et de cette nouvelle vie dans laquelle il peut enfin leur prouver à tous sa supériorité. Il y reconnaît parfois certains visages et prend un plaisir particulier à sacrifier à l’entité Chris et les autres membres de S.T.A.R.S.

Il n’a aucune idée de combien de temps il passe dans cet univers mais alors qu’il est un jour transporté vers un nouveau « trial » il tombe en chute libre et s’écrase dans une ville bien étrange.